Лаборатория биоинформатики

Анализ биологических данных
(NGS, microarray, MS, PCR), биостатистика.

• Оценка роли микроРНК в патогенезе и диагностике эндометриоза
• Применение nmf и t-sne в задаче клеточного типирования на основе экспрессии генов
• Оценка и визуализация дифференциальной экспрессии
  генов
• Разработка программного комплекса для типирования генов системы HLA и KIR
• Применение метода NMF для разделения суммарных экспрессиий генов в ткани на отдельные клеточные типы
• Атлас экспрессии генов в нормальном эндометрии

Разработка масштабируемых программных комплексов, баз данных.

• Система поддержки и автоматизации процесса неинвазивного ДНК скрининга
• Базы данных для медицинских и научных исследований
• Плагины для автоматизации процесса обработки данных сиквенса для ION Torrent Suite

Модели сложных биологических систем и внутриклеточных процессов, анализ биологических и медицинских данных.

• Моделирование процесса деградации биополимерных скаффолодов
• Создание динамической модели структуры микробиоты с использованием методов теории графов
• Математическая модель резорбции биоматериалов адресной доставки лекарственных веществ
• Модель гидролиза алифатических полиэфиров в биологической среде при ограничении диффузии воды

Построение, обучение и внедрение технологии нейросетей, глубинного обучения, методов компьютерного зрения.

• Нейросеть для классификации патологий по данным масс-спектрометрального анализа
• Поиск визуальных паттернов, компьютерное зрение и слежение за объектами по видео на примере поиска направления взгляда новорожденных и анализ их визуальной активности
• Поиск скрытых движений на примере анализа сосательной активности недоношенных по видео