VolcanoR
веб-сервис для анализа результатов дифференциальной экспрессии генов
Возможности:
- гененрация графиков volcano публикационного качества
- настройка параметров - пограничных значений p-value и fold change
- проведение анализа обогащения метаболичесикх путей:
- KEGG
- GeneOntology biological process
В качестве входных данных используется txt файл с результатами диференциальной экспрессии
Примеры работы:
Запустить VolcanoR
Для цитирования используйте публикацию на bioRXiv: VolcanoR - web service to produce volcano plots and do basic enrichment analysis
Для установки локальной версии - воспользуйтесь gitHub : https://github.com/vovalive/volcanoR