Направления

Программное обеспечение для самостоятельного использования
Масспектрометрия
Микрочипы
Неинвазивная диагностика по видео
Высокопроизводительное секвенирование
Математические модели
Анализ данных
Определение аллелей генов HLA

Новости лаборатории

Последние события, новости лаборатории и НЦАГиП

Все новости
Новая система мониторинга АМР

Ученый совет федерального государственного бюджетного учреждения «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И.Кулакова» Министерства здравоохранения Российской Федерации по докладам Припутневич Т.В, Трофимова Д.Ю., Боровикова П.И. принял решение о реализации пилотного проекта «Изучение распределения и интенсивности циркуляции штаммов возбудителей (в т.ч. резистентных) инфекционно-воспалительных заболеваний среди беременных, родильниц и новорожденных в регионах Российской Федерации». Согласно […]

Читать далее
Неинвазивная диагностика

В рамках проекта неинвазивной диагностики новорожденных по видеоряду нами разрабатывается система анализа сосательной активности новорожденных по видео. Энтеральное питание является важным аспектом развития недоношенных детей. Сосательный рефлекс формируется еще во внутриутробном процессе развития и в дальнейшем оказывает воздействие на формирование психики в раннем детстве. По степени развития сосательной активности оценивают развитие ребенка, состояние ЦНС и […]

Читать далее
Микрочипы

Мы работаем с микрочипами: Экспрессионными Метильными SNP-чипы Типичный пайплайн работы: загрузка данных с прибора/с серверов GEO/ArrayExpress нормализация данных, выявление аутлайеров визуализация данных после снижения размерности: PCA  NMF MDS Кластеризация Корреляция между образцами  Выявление дифференциально экспрессированных/метилированных генов Выявление биологического смысла в списках изменённых генов: обогащение KEGG обогащение GEO определение клеток со схожей экспрессией поиск потенциальных микроРНК-регуляторов […]

Читать далее
Терабайт данных
млрд ридов
??  

Команда

Боровиков Павел Игоревич

Боровиков Павел Игоревич

руководитель лаборатории, математик

    Балашов Иван

    Балашов Иван

    Биолог, биоинформатик, биостатистик

      Лагутин Вадим

      Лагутин Вадим

      Программист систем реального времени

        Наумов Владимир

        Наумов Владимир

        Биоинформатик, специалист по геномике человека

          Алтухова Ольга

          Алтухова Ольга

          специалист по моделированию на GPU

            Алексеев Алексей

            Алексеев Алексей

            системный биолог, программист

              Написать нам

              Мы оперативно Вам ответим

              Адрес
              Опарина 4Б Москва
              Контактный e-mail